Le comité est l'organe exécutif et directeur supérieur. Il est constitué au maximum de 7 membres élus : La Présidente ou le Président et d'autres membres de la conférence. Les président-e-s des conférences techniques font en outre partie du comité avec voix consultative. Il traite les affaires courantes et prépare les assemblées plénières. Il peut mandater des personnes ou des groupes permanents ou non permanents, pour le traitement de points particuliers ou d'affaires plus importantes. Le comité élit le ou la secrétaire générale et les autres employées du secrétariat et il approuve le règlement ainsi que le cahier des charges du Secrétariat général.
À l'assemblée plénière du 1er juin 2017 à Berne, les membres suivants ont été élus au comité de la CFP :
Josef Hess
Président de la CFP depuis le 01.07.2017
Conseiller d'Etat du Canton d'Obwald depuis le 01.07.2017 (hors parti),
directeur du Département de la construction et du développement du territoire
David Eray
Membre du comité de la CFP depuis le 01.07.2017
Ministre du Canton du Jura depuis le 18.12.2015 (PCSI),
directeur du Département de l'environnement (DEN)
Stefan Müller
Membre du comité de la CFP depuis le 01.07.2017
Conseiller d'Etat du Canton d'Appenzell Rhodes Intérieures depuis le 26 avril 2015 (hors parti), directreur du Département du paysage et de la forêt
L'assemblée plénière du 29 novembre 2018 à élu au comité directeur de la CFP la Conseillère d'Etat Brigit Wyss :
Brigit Wyss
Membre du comité directeur de la CFP depuis le 29.11.2018
Conseillère d'Etat du canton de Soleure depuis 2017 (Les Verts),
directrice du Département de l'économie
À l'assemblée plénière du 23 novembre 2023 à Saint-Gall, les membres suivants ont été élus au comité de la CFP :
Beat Tinner
Membre du comité de la CFP depuis le 23.11.2023
Conseiller d'Etat du Canton de Saint-Gall depuis 2020 (PLR),
directeur du Département de l'économie
Sandro Patierno
Membre du comité de la CFP depuis le 23.11.2023
Conseiller d'Etat du Canton de Schwyz depuis 2020 (Centre);
directeur du Département de l'environnement
Vassilis Venizelos
Membre du comité de la CFP depuis le 23.11.2023
Conseiller d'État du Canton de Vaud depuis 2022 (Verts),
chef du Département de la jeunesse, de l’environnement et de la sécurité
Roland David
Membre à titre consultatif ; président de la CIC
membre du comité directeur de la CFP depuis le 01.07.2021,
ingénieur forestier EPFZ, Capo Sezione forestale
Holger Stockhaus
Membre à titre consultatif ; président de la CSF
membre du Comité de la CFP depuis le 03.05.2024
Chef de la section Chasse et Pêche du Service des forêts des deux Bâle